8月21日，探索舰队官兵告别华阳堡当地官员和居民，依次驶出港口，往南而去。

22日午后，舰队驶离精卫岛南方海岸线。

24日，舰队司令命令各船转向正东，打开所有风帆，全速前进。

25日，傍晚时分，天空下起了大雪，同时伴随着狂风。为了安全起见，舰队落半帆，降低了船速，小心地行驶在波涛汹涌的海面上。

26日，清晨，舰队司令向“风行4号”发出信号，让它在前面领航，务必保证航线安全。在这片接近南极的海域，开始陆续出现大大小小的冰山，这对整个舰队是致命的威胁。

27日，为了避免碰撞冰山，舰队调整了方向，往北偏移数个维度，虽然因风速的减弱使得船只行驶速度也降了下来，但对整个舰队的安全保证却相应有所提高了。

28日，上午八时，舰队副司令、御武校尉（上尉）匡有杰所在的“风行4号”领航船突然发出警告信号，要求后续舰船紧急避让。在船队的东南侧，出现一座巨大的冰山，由于海上雾蒙蒙的，看不太真切。但匡有杰却立即命令船只降低速度，并转舵东北。

这个决定拯救了一船人的性命，因为那座冰山正好矗立在“风行4号”的前方，由于海上的雾越来越浓，他们在距离冰山不到一里的地方才发现了它。瞭望手最初把冰山误认为是陆地，直到匡有杰及时发出命令，调转船头的行驶方向，他们才将将擦过冰山的边缘，避免了一场巨大灾难的发生。

舰队司令陆祖生随即命令舰队收起了上桅帆，要求各船必须小心谨慎地往前行驶。

9月5日，船员们驶近了一座冰山，试图从上面弄一些冰块上船，再把冰块化成澹水。可惜的是，还没等他们实施这一计划，海上就刮起了大风。在这种情势下，大船如果继续停留在冰山附近，无疑是非常危险的。

9月14日，海上的风势刚刚有所缓和，紧接着又下起了暴雪和冰雹，船上的索具几乎均被冻结住了。舰队遂调整方向，继续往北偏移，以躲避严寒的气候。

9月17日，舰队又经过了几座冰山。到了午后，瞭望手报告，发现一座冰山上有许多散冰。这个时候，天气已经逐渐放晴，舰队司令命令数十名官兵驾驶小船去冰山上取冰块。大块大块的冰被堆放在各船的后甲板上。

船员们将冰块打碎放进桶里，它们融化后形成清凉的澹水，这些澹水足够全体人员喝上一个月。这些冰块上面几乎没有沾上海水，融化之后的水，既新鲜又甘甜。

9月20日，天气变得异常和缓，海面风平浪静，久违的阳光也照射在舰队官兵的身上，显得温暖而又惬意，军官们命令所有船员立即将身上湿重的呢大衣和呢绒裤脱下，并清洗干净，利用这难得的好天气，将其晾晒。甲板上也生起了数个煤炉，为所有官兵烧上一罐罐滚烫的开水，泡制一杯杯清香扑鼻的茶水，或者浓郁的咖啡。

有暇的船员，开始捕猎海燕和企鹅。企鹅身上披着厚厚一层羽毛，又长又窄，呈细密的鳞片状。由于企鹅长期生活在湿润的环境中，这件这件特殊的羽衣可以保护它们不被海水浸透。大自然还赋予了企鹅一具厚厚的皮囊，让它们在冰天雪地中依然能活蹦乱跳。而现在，肥美的企鹅肉，在洒满了各种香料的大锅里炖着，散发出一阵阵浓郁的香味。

9月28日，探索舰队几艘船上的瞭望手几乎同时发出兴奋的讯号，距离舰队约十多公里处，发现陆地。舰队指挥官陆祖生观察了远处的陆地后，与几名领航员、绘图师将舰队所处的经纬度与世界堪舆图稍稍一对比，便已经能够确定，他们已经抵达了美洲大陆的最南端——被称为火地群岛的西部海岸，那里应该是靠近被西洋夷人称作为麦哲伦海峡的西边出入口。

这段航行，是探索舰队第一次在高纬度地区直接穿越这片海洋（太平洋），按照陆祖生的说法，是从未经历过如此无趣的漫长旅程。